A List of the Most Popular Family Names in Japan

1     佐藤     Satō
2     鈴木     Suzuki
3     高橋     Takahashi
4     田中     Tanaka
5     渡辺 (渡邊)     Watanabe
6     伊藤     Itō
7     山本     Yamamoto
8     中村     Nakamura
9     小林     Kobayashi
10     斎藤 (斉藤)     Saitō

11     加藤     Katō
12     吉田     Yoshida
13     山田     Yamada
14     佐々木     Sasaki
15     山口     Yamaguchi
16     松本     Matsumoto
17     井上     Inoue
18     木村     Kimura
19     林     Hayashi
20     清水     Shimizu

21     山崎     Yamazaki / Yamasaki
22     森     Mori
23     阿部 / 安倍     Abe
24     池田     Ikeda
25     橋本     Hashimoto
26     山下     Yamashita
27     石川     Ishikawa
28     中島     Nakajima / Nakashima
29     前田     Maeda
30     藤田     Fujita
31     小川     Ogawa
32     岡田     Okada
33     後藤     Gotō
34     長谷川     Hasegawa
35     村上     Murakami
36     近藤     Kondō
37     石井     Ishii
38     坂本     Sakamoto
39     遠藤     Endō
40     青木     Aoki
41     藤井     Fujii
42     西村     Nishimura
43     福田     Fukuda
44     太田     Ōta
45     三浦     Miura
46     藤原     Fujiwara
47     岡本     Okamoto
48     松田     Matsuda
49     中川     Nakagawa
50     中野     Nakano

Taken from the Japanese Yellow Pages.